이번 7월 26일 monthly meeting에서는 오성환 박사님의 회장 출마의 변으로 모임을 시작하였습니다. 오성환 박사님은 annual meeting에서 화려한 banquet 진행 실력을 보이시면서 많은 사람들의 관심을 모았었습니다. 아직 후보 투표 결과를 봐야 하기는 하지만, 아마 다음 NEBS 회장으로 이만큼 적당한 사람을 찾기도 힘들지 않을까 개인적으로 생각해봤습니다.
이번 모임에서는 BWH에서bioinformatics를 하시는 이은정 박사님께서 “analysis of somatic transposition in human cancer”라는 제목으로 먼저 발표를 해 주셨습니다. Human genome sequencing 중에서 tumor에 대한 자료가 누적되는 상황에서 tumor와 연관된 genome data analysis는 현재 가장 중요한 관심 분야가 아닌가 생각됩니다. 이박사님은 기존 database에서 얻을 수 있었던 glioblastoma, ovarian cancer 및 lung cancer에서 나온 sequence 자료를 가지고 분석한 방법에 대해서도 흥미롭게 설명을 해 주셨는데,  transposon들에서 주로 이용되는 target primed reverse transcription 상황에서 genome에 남게 되는 sequence tag을 이용해서 방대한 양의 data 중에서 tumor에서 transposon이 얼마나 많이 움직이나를 확인하셨습니다. 몇 가지 tumor에서는 상당한 transposon의 활성을 확인할 수 있었습니다. 아마도 일부 transposon의 이동이 그 주변 gene의 발현을 변화시키고, 그 결과 이러한 세포들이 proliferation활성이 높아져서 tumor가 되지 않을까 추정을 된다고 설명을 주셨습니다. 앞으로 이러한 transposon의 활성 증가가 tumor 발생에 영향을 주는지, 준다면 어떤 기작으로 이루어지는지를 확인하는 일이 상당히 흥미로와 보였습니다. 이 박사님의 발표를 들으면서 들었던 한가지 생각은 , Sequencing cost가 낮아지면서  data가 너무 빠른 속도로 쌓이고 있기 때문에,  어떻게 하면 효과적으로 이러한 자료를 분석해서 정보를 얻을 수 있느냐하는 문제가 제기되는 것은 당연히 예상되는 결과가 아닌가 하는 점이었습니다. 앞으로는 sequencing 기술의 개선보다는 data analysis 비용을 낮추기 위한 computer scientist들의 활약이 더 중요할 것이라는 점을 시사하는 발표였습니다.
이어진 5 min break 시간에는 오성환 박사님이 보스턴에 있는 brewery들에 대해서 소개를 해 주셨습니다. 사실 저도 아직 한 번도 안가봤는데, 다음에 사람들 모아서 한 번 부어라 마셔라 해봐야 겠다는 생각이 드네요.
두 번째 발표하신 분은 MGH에서 일하고 계신 박동수 박사님으로 osteoblast의 발생 과정을 mouse를 이용해서 아주 분명하게 분석하신 결과를 보여주셨습니다. Tumor를 연구하시는 분들은 EMT라고 해서 epithelial cell이 mesenchymal cell로 전이되는 과정이 tumor라는 concept이 많이 통용이 되고 있습니다. 또한, 발생과정에서 stem cell을 포함하는 mesenchymal cell이 여러 다른 tissue로 분화를 하는 것도 대부분의 사람들이 받아들이고 있습니다. 하지만, 정작 mesenchymal cell의 정체가 뭔지에 대해서는 정의가 분명하지 않습니다. 박박사님은 Osteocalcin-Cre-ER transgene/ tamoxifen과 reporter인 Rosa-EYFP transgene을 이용해서 osteoblast를 EYFP로 표지를 하여서  intravital 2 photon microscopy를 사용해서 이 세포들의 수명의 한계와  stem cell이 그 안에 존재하지 않는다는 보이고, 다시 interferon 발현에 중요한 Mx1 gene의 promoter에 Cre가 연결된 transgene과 Rosa-tdTomato transgene을 이용해서 이 세포 들에 osteoblast의 renewal에 중요한 stem cell이 있다는 것을 보이셨습니다. 특히, 이러한 세포들이  Osteocalcin-GFP로 표지된 세포들과 거의 대부분 동일하다는 것을 보이셔서 osteoblast에 대한 근원을 확실하게 규명을 하셨습니다. 앞으로 뼈의 regeneration에 관련된 분야에서 중요한 연구의 초석을 놓으신 것으로 생각됩니다.
이제 앞으로 monthly meeting을 한 번만 더 하면 이번 회기도 끝이군요. 모두들 건강하게 지내십시오.